方舟拿到地皮后，因为业务没有起色，地皮一放就是三年。2004年下半年，在放弃CPU研发作为公司重心的同时，中关村软件园和方舟科技各自出资3000万元建方舟大厦。双方约定,建成后中关村软件园公司对其中一半面积拥有4年的使用权，此后方舟科技公司归还3000万元本金，中关村软件园则归还使用权。方舟科技从此开始忙着盖大楼，不少到方舟的人都被李德磊拉着去看大楼。“在中国，有了地就有钱。中国真正赚钱的不是高科技，而是房地产。”
对于公众的质疑，苏佳伟解释说，2004上半年公司面临破产，公司做出了两个战略调整。一个是从研发向市场为重心转变,另外一个是业务多元化转变。通过借助美国公司Spansion的资金、市场和渠道，方舟科技联合国内企业和他们在消费电子产品上进行合作。2005年,经过多元化的方舟公司总收入已超过4000万元，完全能够支付盖楼的钱。李德磊也证实了这个说法。
虽然如此，“863”专家仍不禁质问，李德磊说2004年方舟科技面临破产，那么那里来的钱启动新业务？倪光南质疑，UT斯达康因为小灵通几乎被纳市摘牌，李德磊靠小灵通就赚了钱？再说方舟的科技队伍和资源是国家的钱支撑起来，国家任务不做，却去做面向Spansion公司的外包挣钱，这又是什么行为？
记者手记：我的采访历程
“汉芯造假”被曝光之前，业界对方舟事件已经不太关注。但倪光南院士公开承认在方舟研发上的错误引发记者关注此事，并亲自跑到方舟科技公司求证此事。
方舟科技市场部专门负责此事的一位小姐让记者发传真。过了几天，李德磊亲自致电记者，说“要用事实说话，以给自己清白”。记者如约见到李德磊，奇怪的是，李不仅没有出具什么资料，还只在简单地解释原因后要求记者不能报道。李德磊的说法是顾虑涉及利益太多，为一些人的忌讳，还没有想好怎么给公众一个官方的解释。在记者后来的调查过程中，发现此事涉及高层多多、方方面面很多利益。
当天中午，李德磊授权公司董事苏佳伟(股东公司深圳中纬实业发展有限公司在方舟董事会的派驻代表)和记者吃饭沟通。苏先生认为事情根本的原因是刘强和倪光南与李德磊在公司发展方向不一致而造成了各种问题。苏佳伟还说李德磊业务很忙，现在不便公开接受采访。记者然后开始采访倪光南、胡铭曾等其他知情人士。
采访工作全部结束后，记者联系把报道草稿发给各受访方。除了因李德磊出差(方舟科技市场部人士语)联系未果，其他当事人都认可了报道内容。奇怪的是，方舟科技市场部曾答应周一(6月5日)给出答复，但记者迟迟不曾等到。
6月15日，本刊总编室为表慎重，再次将文章发给各个当事人核实。当事人再度表示对稿件无任何异议。是日深夜，记者接到苏佳伟从广州打来的电话，对记者报道进行大量质疑，并威胁记者文章一旦刊发将到“法庭上见”。他还要求记者将此意转告倪光南等人。URl收藏 http://www.qqread.com/news/g407130001.html进入讨论组讨论。
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