1.基本情况与功能支持
首先我们来看一下表1、2、3，它们从各个方面对NTFS/FAT32/FAT16的基本情况及支持的功能进行了综合比较。
表 1
表 2
表 3
2.文件系统优缺点
从表3中我们可以看到几个文件系统的优缺点。
3.选择何种文件系统?
普通用户在决定采用什么样的文件系统时应从以下几点出发：
1） 单一系统还是多启动的系统（即多操作系统）；
2） 硬件平台；
3） 硬盘的大小与数量；
4） 安全性考虑。
在系统的安全性方面，NTFS文件系统具有很多FAT32/FAT16文件系统所不具备的特点，而且基于NTFS文件系统的Windows 2000/XP/2003运行要快于基于FAT文件系统的；而在与Win 9X的兼容性方面，FAT优于NTFS。
如果要在Windows 2000/XP/2003中使用大于32GB的分区的话，那么只能选择NTFS格式。但从另外一个角度来看，NTFS本身所需耗费的资源多于FAT的，所以如果格式化比较小的分区（低于512MB），建议使用FAT16。
正如微软专家建议那样，“除了多引导配置必须从非NTFS文件系统启动之外，建议用户用NTFS格式化所有的分区。” NTFS分区仅能通过Windows NT/2000/XP/2003进行访问。如果你的Windows 操作系统发生致命错误，你将无法简单地通过系统盘引导至命令行方式并解决NTFS分区上所出现的问题。为避免出现这种问题，建议在硬盘上安装第二套Windows操作系统，并通过这套操作系统来解决NTFS分区上所出现的问题。
表格说明：
●表1中的“最大容量”为理论值，“可实现最大分区容量”为目前OS可支持的最大容量；
●Windows NT必须先升级到server pack4或以上的版本才能识别FAT32和Windows 2000/XP/2003的NTFS新版本文件系统；
●FAT32只是在理论上支持2TB的最大空间，在实现时，Windows 98OSR2/ME最大只能支持127.53GB，而Windows 2000/XP/2003只支持32GB；
●16EB等于2~64字节，或等于16384TB；
●FAT16在Windows 2000/XP/2003系统下可实现的最大格式化容量为4GB（可实现每簇最大容量64KB）
对于新买的或者需要重新分区的硬盘，我们可用以下的各种方法创建分区。
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